RSUP H. Adam Malik dipimpin oleh 1 (satu) Direktur Utama. Dalam melaksanakan tugas, Direktur Utama dibantu 3 (tiga) Direktur yaitu:
dr. Zainal Safri, SpPD-KKV, SpJP(K)(Direktur Utama)
Dr. dr. Fajrinur, SpP(K), M.Ked(Paru) Direktur Medik, Keperawatan dan Penunjang )
Supomo, SE, M.Kes (Direktur Perencanaan, Keuangan dan Barang Milik Negara)
Drs. Jintan Ginting, Apt, M.Kes. (Direktur SDM, Pendidikan dan Umum)